Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms