Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad23aP54726 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms