Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PctpP53808 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PctpP53808 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms