Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FanccP50652 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FanccP50652 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FanccP50652 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FanccP50652 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FanccP50652 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FanccP50652 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FanccP50652 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FanccP50652 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FanccP50652 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms