Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TspoP50637 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TspoP50637 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TspoP50637 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms