Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms