Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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PtpreP49446 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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