Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptx3P48759 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptx3P48759 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms