Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx2P48379 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rfx2P48379 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx2P48379 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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