Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VdrP48281 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VdrP48281 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms