Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41P48193 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms