Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myo1bP46735 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms