Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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