Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtlP38585 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtlP38585 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms