Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HmgclP38060 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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