Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig1P37913 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms