Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn11P35235 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms