Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stfa1P35175 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms