Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms