Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SsbP32067 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SsbP32067 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SsbP32067 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SsbP32067 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms