Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou3f3P31361 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou3f3P31361 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou3f3P31361 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f3P31361 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f3P31361 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou3f3P31361 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms