Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxa2P31245 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxa2P31245 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms