Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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