Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms