Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CftrP26361 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CftrP26361 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CftrP26361 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CftrP26361 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CftrP26361 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms