Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms