Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RarbP22605 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms