Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pou5f1P20263 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms