Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18530 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18530 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms