Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FosbP13346 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FosbP13346 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FosbP13346 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FosbP13346 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms