Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms