Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms