Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01747 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01747 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01747 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01747 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01747 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01747 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01747 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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P01747 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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P01747 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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P01747 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01747 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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