Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms