Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10226O88253 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10226O88253 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms