Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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