Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms