Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffaO54786 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffaO54786 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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DffaO54786 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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