Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrxO54751 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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CrxO54751 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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CrxO54751 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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CrxO54751 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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CrxO54751 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrxO54751 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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