Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk2O35491 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clk2O35491 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Clk2O35491 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms