Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dgcr6O35347 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms