Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kpna4O35343 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms