Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmiO35309 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmiO35309 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmiO35309 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmiO35309 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmiO35309 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmiO35309 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmiO35309 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmiO35309 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmiO35309 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmiO35309 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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NmiO35309 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmiO35309 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmiO35309 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmiO35309 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmiO35309 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmiO35309 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmiO35309 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmiO35309 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmiO35309 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms