Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pitx3O35160 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms