Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casq1O09165 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms