Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hps1O08983 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hps1O08983 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hps1O08983 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms