Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms