Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx2O08686 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx2O08686 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms