Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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