Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gm379J3QQ19 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm379J3QQ19 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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